Sekolah Tinggi Agama Islam Muhammadiyah Tulungagung (kemudian disebut STAI Muhammadiyah Tulungagung) merupakan perguruan tinggi swasta berkedudukan di wilayah administratif Kabupaten Tulungagung Provinsi Jawa Timur yang diselenggarakan oleh Persyarikatan Muhammadiyah, melalui Majelis Diktilitbang. 

Berdiri pada tahun 1987 dengan nama Fakultas Tarbiyah Universitas Muhammadiyah Surabaya di Tulungagung, sesuai dengan SK nomor 354/K/F-9/P/87 yang ditandatangani oleh Rektor IAIN Sunan Ampel selaku Ketua Kopertais IV Wilayah Surabaya. Pada Tahun 1990 mengalami perubahan status menjadi Sekolah Tinggi Ilmu Tarbiyah Muhammadiyah Tulungagung (STIT Muhammadiyah Tulungagung) sesuai SK nomor Dj./219/210. Untuk memenuhi kebutuhan masyarakat akan pendidikan, pada tahun 2010 dibuka Program Studi baru yaitu Ekonomi Syari’ah , sekaligus alih status menjadi Sekolah Tinggi Agama Islam Muhammadiyah (STAIM) Tulungagung sesuai SK nomor Dj.I/200/2010. 

Saat ini STAI Muhammadiyah Tulungagung memiliki 3 (tiga) Program Studi yaitu Pendidikan Agama Islam (PAI) dengan peringkat akreditasi B sesuai dengan SK BAN PT nomor 0102/SK/BAN PT/Akred/S/III/2016; Pendidikan Guru Madrasah Ibtidaiyah (PGMI) dengan peringkat akreditasi C sesuai dengan SK BAN PT nomor 1167/SK/BAN PT/Akred/S/XI/2015; dan Ekonomi Syari’ah dengan peringkat akreditasi C sesuai dengan SK BAN PT nomor 0102/SK/BAN PT/Akred/S/III/2016. Sesuai dengan Rencana Induk Pengembangan (RIP) 2010, Renstra 2014-2019 dan Statuta 2015, STAI Muhammadiyah Tulungagung memiliki Visi “Menjadi Perguruan Tinggi Islami yang berdaya saing dan unggul dalam bidang spiritual, emosional dan sosial pada tahun 2025”.