Sekolah Tinggi Ilmu Kesehatan (STIKES) Muhammadiyah Kendal sebelumnya adalah Akademi Keperawatan (AKPER) Muhammadiyah Kendal lahir dan berdiri atas dorongan dan dukungan masyarakat. AKPER Muhammadiyah Kendal berdiri pada 27 Februari 1996 berdasarkan Keputusan Menteri Kesehatan RI Nomor : HK. 00.06.1.1.548.37. Awalnya AKPER Muhammadiyah Kendal menempati Gedung Perguruan Muhammadiyah di Jalan Pemuda 75 Kendal lalu secara resmi berpindah ke kampus baru di Jalan Ar-Rahmah 18 Weleri Kendal pada tahun 2000. Dalam rangka pengembangan Institusi, AKPER Muhammadiyah Kendal kembali berpindah pada tahun 2011 di Gedung Pusat Dakwah Muhammadiyah Kendal di Jalan Pemuda 42-46 Kendal hingga sekarang dan telah berubah bentuk menjadi STIKES Muhammadiyah Kendal berdasarkan SK. MENRISTEKDIKTI NOMOR : 17/KPT/I/ 2018 dengan 4 Program Studi yaitu S1 Gizi, D3 Keperawatan, S1 Keperawatan dan Ners. Pembenahan terus dilakukan baik fisik maupun non fisik. Dalam upaya meningkatkan kualitas perguruan tinggi, STIKES Muhammadiyah Kendal kembali merencanakan pembangunan sebuah kampus Terpadu di Jl. Ar-Rahmah 18 Weleri Kendal.