Dalam rangka melengkapi wadah pendidikan yang dikelola Muhamadiyah, maka sejak tahun 2015 telah dirintis berdirinya Perguruan Tinggi Universitas Muhammadiyah Maluku (Unimku). Usaha tersebut akhirnya membuahkan hasil pada tahun 2020 mendapatkan ijin operasional dari Kementerian Pendidikan dan Kebudayaan, Republik Indonesia Nomor : 1189/M/2020 tanggal SK pendirian 30 Desember 2020 untuk menyelenggarakan Program Studi S-1 Program Studi Pend. Matematika, Pend. Biologi, Kehutanan, Ilmu Kelautan dan Perikanan Tangkap.